Счита се, че Горнодиканският манастир е строен през късното Средновековие (XV-XVII век). Манастирската църква е възстановена през 1884 г. Тогава старият средновековен храм е бил надграден, а в западната част има малко преддверие. През следващата година е направена и стенописната украса, от която днес са останали отделни фрагменти върху източната стена в притвора. Те представляват картини от композицията Страшния съд. В началото на XXI век църквата е ремонтирана, с което е засегната автентичността на паметника. Манастира е недействащ.