Черното езеро се намира в централната част на Рила, западно от Смрадливите езера, на един от притоците на Рилска река. Площта му е около 4,8 ха. и е едно от най-трудно достъпните в Рила. Разположено е във висящ циркус, заграден от изток от хребета, делящ го от хребета на Смрадливото езеро.
Като локация на езерото избрахме леснодостъпно възвишение, предлагащо прекрасна гледка към езерото.