Бобошевският манастир е построен през 9-10 век. Намира се на източния склон на връх Бобошевски Руен, до град Бобошево, област Кюстендил. Представлява комплекс от черква и жилищни сгради и е датиран като средновековен.
Той е един от най-старите български манастири. Разрушен е при падането на България под турско робство и е възобновен през 15 век. От стария комплекс днес е останала само църквата, богато украсена със стенописи.
Днес Бобошевският манастир не функционира.